Mudanças entre as edições de "Minicluster:Linux"
De WikiLICC
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Outros (Head Node) | Outros (Head Node) | ||
Edição das 23h16min de 18 de junho de 2017
Para versão Fedora13, ver Minicluster:Linux:Fedora13
O pacote MPICH2 é fornecido para os Linux:
- Debian 1.2.1
- Ubuntu 1.2 (based on Debian)
- Fedora/RHEL/CentOS 1.2.1
- Gentoo
- FreeBSD 1.2.1
Uma opinião do controle de Tsunamis
- [1] We tried several Linux flavours, including Red Hat, Mandrake, Fedora etc,...Debian as the most stable in servers, especially when things are being done pretty much in automatic mode. In our workstations the preference among programmers is Ubuntu, which is basically Debian-based...
Mesmo assim, não há preferências claras e acabamos escolhendo o Fedora pois possui ampla documentação na internet e está em continua atualização. No momento a versão atual é Fedora 13 e a máquina possui arquitetura x86-64.
Índice
Fedora25
- Download do Fedora-25-Workstation 64 bits.
- Selecionar o drive: (ATA ST32500318AS) com tamanho 238475 MB (Serial Number 9VY0K045)
Partições
Criar as partições.
- Selecionar Create custom layout. Crie as partições:
- /boot: 1000 MiB, ext4, /sda1
- /home: 5 GiB, ext4, /sda2
- /: 50 GiB, ext4, /sda3
- /swap: 5 GiB, swap, /sda5
Seta o nome da máquina mestre:
hostnamectl set-hostname one
Pacotes Fedora 25
- Instalar
dnf group install lxde-desktop
- Remover
dnf remove vim-minimal # conflito com o vim-enhanced abaixo
- Instalar
dnf install sudo # removido com o comando acima? dnf install htop atop dnf install vim-enhanced emacs dnf install terminator dnf install gcc-gfortran gcc-g++
dnf install mariadb php
- Instalar gcc 4.9
- Ativar ssh
systemctl enable sshd.service # habilita iniciar no boot systemctl start sshd.service # inicia o sshd
- Outros:
- Linux:Pacotes
- firefox, java-1.x.x, thunderbird, cmake,
Outros (Head Node)
- Servers/DNS Name
Configurações: mestre e escravo
- Desabilitar alguns serviços (ver Serviços):
[root@cell100]$ chkconfig --del bluetooth [root@cell100]$ chkconfig --del ip6tables [root@cell100]$ chkconfig --del irda [root@cell100]$ chkconfig --del speech-dispatcherd [root@cell100]$ chkconfig --del btseed [root@cell100]$ chkconfig --del bttrack [root@cell100]$ chkconfig --del dc-client [root@cell100]$ chkconfig --del dc-server
- Somente escravo
[root@cell100]$ chkconfig --del cups
- Configurações para todos os usuários
- Na inicialização:
[root@one]$ vi /etc/profile.d/usuarios.sh
# configuracoes pessoais
if [ "$PS1" ]; then
PS1="[\u@\h:\l \W]\\$ ";
if [ `id -u` = "0" ]; then
PS1='\[\033[01;31m\]\u\[\033[01;37m\]@\[\033[01;32m\]\h\[\033[01;34m\] \w \[\033[01;33m\]\$\[\033[00;37m\] ';
else
PS1='\[\033[01;33m\]\u\[\033[01;37m\]@\[\033[01;32m\]\h\[\033[01;34m\] \w \[\033[01;33m\]\$\[\033[00;37m\] ';
fi
fi
PATH=$PATH:$HOME/bin
export PATH
alias vi=vim
# LANG="en_US.UTF-8"
- O que estiver no diretório /etc/skel (testar) é copiado para todos os usuários.
Configurações: mestre
Placa de rede e Internet
Na máquina mestre foi adicionada uma placa de rede extra para comunicação com o exterior (na verdade essa está ligada ao switch e a placa onboard está ligada a web).
Apenas na primeira vez foi necessário liberar a placa de rede onboard para acessar a rede UFRGS
- Usando o Firefox, foi informado o nome da máquina one
- A máquina mestre recebeu o IP 143.54.226.116
Update
Atualizar os pacotes do Linux
[root@one]$ dnf update dnf [root@one]$ dnf update [root@one]$ dnf install mpich2 [root@one]$ dnf install mpich2-devel
Adicionar o pacote WakeOnLan
[root@one]$ dnf install wol
TODO: Adicionar comandos para atualização de todos os pacotes via comando!
Hostnames
[root@one]$ vi /etc/hosts # hostname um.phantom added to /etc/hosts by anaconda 127.0.0.1 localhost localhost.localdomain localhost4 localhost4.localdomain4 one.matrix ::1 localhost localhost.localdomain localhost6 localhost6.localdomain6 one.matrix 192.168.0.100 cell100.matrix cell100 192.168.0.101 cell101.matrix cell101 192.168.0.102 cell102.matrix cell102 143.54.226.61 euler.mat.ufrgs.br euler 143.54.226.118 hunter.mat.ufrgs.br hunter
Firewall
Foi necessário desativar o firewall do linux, via iptables (configurar de maneira correta seria uma opção melhor, mas para o momento deixamos sem [2])
[root@one]$ /etc/init.d/iptables save [root@one]$ /etc/init.d/iptables stop
Se for necessário reiniciar use:
[root@one]$ /etc/init.d/iptables start
Veja em [3] e [4] e followups.
SELinux
Off no momento. Veja SELinux.
Usuários e grupos
Mudar o grupo 500 para grupo docentes e adicionar o grupo 501 alunos,
[root@one]$ groupmod -g 500 -n docentes dago [root@one]$ groupadd -g 501 alunos [root@one]$ grep 50[0-1] /etc/group docentes:x:500: alunos:x:501:
Escravo: Configurações
Update e Instalação
Não possui acesso a internet. Existem várias possibilidades, porém estou tentando o seguinte:
- Baixar os pacotes .rpm necessários na máquina mestre e copiá-los para a máquina escravo.
tcl-8.5.7-5.fc13.x86_64.rpm environment-modules-3.2.7b-7.fc13.x86_64.rpm mpich2-1.2.1p1-2.fc13.x86_64.rpm mpich2-devel-1.2.1p1-2.fc13.x86_64.rpm
- Importar as keys necessárias para instalar os pacotes (não instalou direito usando apenas rpm):
[root@cell100]$ rpm --import /etc/pki/rpm-gpg/RPM-GPG-KEY-fedora-x86_64
ou melhor ainda, editar /etc/yum.conf para não reclamar sobre signature files
[root@cell100]$ vi /etc/yum.conf .. gpgcheck=0 ..
- Instalar usando yum
[root@cell100]$ yum localinstall tcl-8.5.7-5.fc13.x86_64.rpm --disablerepo=fedora --disablerepo=updates [root@cell100]$ yum localinstall environment-modules-3.2.7b-7.fc13.x86_64.rpm --disablerepo=fedora --disablerepo=updates [root@cell100]$ yum localinstall mpich2-1.2.1p1-2.fc13.x86_64.rpm --disablerepo=fedora --disablerepo=updates [root@cell100]$ yum localinstall mpich2-devel-1.2.1p1-2.fc13.x86_64.rpm --disablerepo=fedora --disablerepo=updates
Two cores ALIVE
grep -i core /proc/cpuinfo model name : Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU E7500 @ 2.93GHz core id : 0 cpu cores : 2 model name : Intel(R) Core(TM)2 Duo CPU E7500 @ 2.93GHz core id : 1 cpu cores : 2
Comando top
O comando top é utilizado para verificar quais processos estão rodando.
[user] $ top Tasks: 168 total, 2 running, 166 sleeping, 0 stopped, 0 zombie Cpu0 : 1.0%us, 0.8%sy, 0.0%ni, 77.1%id, 20.6%wa, 0.4%hi, 0.0%si, 0.0%st Cpu1 : 1.3%us, 0.9%sy, 0.0%ni, 80.8%id, 17.0%wa, 0.0%hi, 0.0%si, 0.0%st Mem: 2031852k total, 1858956k used, 172896k free, 109204k buffers Swap: 5119988k total, 0k used, 5119988k free, 1028704k cached
PID USER PR NI VIRT SHR S %CPU %MEM TIME+ PPID P TIME CODE COMMAND 13192 root 20 0 398m 8148 S 3.2 4.8 0:06.85 13168 0 0:06 4 programa1 12793 dago 20 0 544m 18m S 0.3 1.5 0:04.14 1 1 0:04 4 top
Veja o manual com
man top
- Opções interessantes
- clique no programa top aberto.
- h : mostra um help
- 1 : mostra um/ou mais processadores
- f : adiciona mais colunas. Use j para coluna processador
- z : habilita cores
- u : mostra um usuário especi~fico
- W : Escreve arquivo de configuração
Salve suas configurações com a opção W.
Kernel
Último kernel instalado:
[root]$ uname -a Linux one.matrix 2.6.34.7-61.fc13.x86_64 #1 SMP Tue Oct 19 04:06:30 UTC 2010 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
Outras versões:
- 2.6.33.8-149.fc13.x86_64: [ OK ]
- 2.6.32.11-99.fc12.x86_64: [ ERRO ] NÃO está terminando de dar o boot (tranca depois de habilitar a tela gráfica sem fornecer a caixa para login).
- 2.6.31.5-127.fc12.x86_64: [ OK ]
Veja também
- Voltar a Minicluster
- Minicluster:Hardware
