Exibir código-fonte para MiniCluster de 4 computadores

O [[LICC]]-IM/UFRGS conta também com um "cluster" de quatro processadores Pentium IV 2GHz com 256MBytes de memória e 20GBytes em disco cada, interligados através de um "switch" a 100Mbps e dotado de compiladores de alto desempenho HPF, Fortran90/95 e C, para o desenvolvimento de pesquisas na área de computação paralela, nas áreas de álgebra linear computacional e dinâmica de fluidos computacional.

O cluster é composto por 4 máquinas que possuem o mesmo hardware: tunnan, lansen, draken, viggen (alguns softwares estão instalados apenas em alguma das máquinas, p.ex., o programa jumpshot está instalado na viggen.)

==Instruções para utilizar o cluster em paralelo==

# Requisitar uma conta de usuário nas 4 máquinas: tunnan, lansen, draken, viggen. Veja [[Acesso aos computadores (contas de usuário)]].
# Conectar-se a uma máquina através de uma das 3 alternativas:
#* localmente: utilize uma das 4 máquinas diretamente fornecendo o usuário e senha.
#* em uma das máquinas do departamento de matemática: utilize o SSH para conectar-se a uma das 4 máquinas.
#* fora do departamento de matemática: utilize o SSH para conectar-se a euler (ou outra máquina do DMPA que permita acesso externo). Depois, utilize o SSH para conectar-se a uma das máquinas do cluster (note que o usuário e senha da euler pode ser diferente).

==Utilizando o SSH==
Conectando-se remotamente a uma máquina: login

* Em Linux: utilize um cliente SSH (p.ex. openssh); exemplo de uso:

 ssh usuario@euler.mat.ufrgs.br

* Em Windows: utilize um cliente PUTTY; (256Kb ) (mostre-me)

==Transferência de arquivos==

* Em Linux: SCP, um serviço embutido no mesmo cliente openssh; Ex. uso:

 scp arquivo.txt usuario@euler.mat.ufrgs.br:~ 

 scp usuario@euler.mat.ufrgs.br:~/arquivo.txt

 scp -r usuario@euler.mat.ufrgs.br:~/diretorio . 

* Em Windows, tecnologia SFTP, via cliente PSFTP da distribuição PUTTY; (412Kb) 
* Em Windows, tecnologia SFTP, via cliente WINSCP da distribuição FREEWARE WinSCP; (1.48Mb)
* Em sistemas com Java instaldo (JDK), tecnologia SFTP combinada com Java, via cliente MindTerm (bin-1.2Mb, doc-1.6Mb)

==Configurações==

* Mude para o seu diretório home
  [usuario@viggen] cd 
* Crie um arquivo .mpd.conf
  [usuario@viggen] vi .mpd.conf
informando uma palavra chave para o MPD
  MPD_SECRETWORD=senhaparampi

* Mude o acesso para o arquivo

  [usuario@viggen] chmod 600 .mpd.conf

* Crie um arquivo .mpd.hosts
  [usuario@viggen] vi .mpd.hosts

informando o nome das máquinas que formam o cluster
  tunnan.mat.ufrgs.br
  draken.mat.ufrgs.br
  viggen.mat.ufrgs.br
  lansen.mat.ufrgs.br

* Crie um arquivo .rhosts

  [usuario@viggen] vi .rhosts

com o nome das máquinas que formam o cluster e o seu nome de usuario informando que esse usuário pode ter acesso a sua conta através de rsh
  tunnan.mat.ufrgs.br usuario
  draken.mat.ufrgs.br usuario
  viggen.mat.ufrgs.br usuario
  lansen.mat.ufrgs.br usuario

==Inicializando o cluster==

* Antes de rodar um programa em paralelo é necessário conectar as máquinas em paralelo. Com as máquinas ligadas (apenas uma vez a cada sessão), digite
  [usuario@viggen]$ mpdboot -n 4 -f ~/.mpd.hosts --rsh=rsh

* Para verificar que tudo está funcionando corretamente, digite
  [usuario@viggen]$ mpdtrace

A resposta desse comando deve ser algo como a lista das 4 máquinas
  tunnan
  viggen
  draken
  lansen

==Compilando e rodando um programa em paralelo==

* Crie um programa inicial, digitando

  [usuario@viggen]$ vi hellompi.f90

com o seguinte código:

  program hellompi
  implicit none
  include "mpif.h"
  integer    ::  np, myid, ier
 
  call MPI_Init( ier )
  call MPI_Comm_size( MPI_COMM_WORLD, np,   ier)
  call MPI_Comm_rank( MPI_COMM_WORLD, myid, ier)
 
  print *,"Sou o processo ", myid," de um total de ", np
  call MPI_Finalize( ier )
  end program

* Para compilar o programa, digite
  [usuario@viggen]$ mpif90 hellompi.f90 -o hellompi

* Para rodar o programa, digite
  [usuario@viggen]$ mpiexec -n 4 ./hellompi &

==Utilizando o MPE==

* Para compilar o programa:
  [usuario@viggen]$ mpif90 hellompi.f90 -o hellompi -mpe=mpilog

* Para rodar o programa:
  [usuario@viggen]$ mpiexec -n 4 ./hellompi &

* Depois de rodar o programa, um arquivo Unknows.clog2 foi criado. Para visualizar a iteração entre os computadores:
  [usuario@viggen]$ jumpshot Unknown.clog2


== Ligações externas ==
*[http://www.cacr.caltech.edu/beowulf/tutorial/building.html http://www.cacr.caltech.edu/beowulf/tutorial/building.html]

* http://abax.if.usp.br/drupal5/files/delyra_cluster.pdf
* http://abax.if.usp.br/drupal5/files/